北京市第十三中学分校1998年建校，是北京市优质纯初中校。 1998年建校时，经市、区教委批准将原106中转制“民办公助”体制初中校，由北京市第十三中学承办。2005年市教委又将“民办公助校”统一改为“公办学校体制改革试点校”。2008年十三中分校回归公办校体制，结束试点。从1998—2008年十年的转制中，学校充分发挥新机制的优势，给办学注入活力。2013年学校重新翻建，借三址办学，2015年重回美丽校园。2018年7月学校与北京市第四十一中学合并，形成了现在的两个校区，即什刹海校区和诚毅校区。

两个校区都位于北京市中心，什刹海校区坐落在著名的什刹海风景区，北临德胜门，东临南锣鼓巷，交通便利，环境优雅。诚毅校区位于西四北二条（原名帅府胡同）,南邻“历代帝王庙”,西望千年“白塔寺”。

学校现有七、八、九三个年级，什刹海校区和诚毅校区现共有46个教学班，在校生2000余人。教职工210人，其中市级骨干教师1人，区级骨干教师50人，高级教师66人，一级教师65人。在教师队伍中研究生学历占比42%，党员人数占教职工总数60%。学校教师具备高水平的专业素质和丰富的教学经验，兢兢业业地为学生的成长发挥着重要作用。历年来，我们在教育教学质量上保持了较高的水平，教师多次在市区级教学比赛中获得好成绩，在各类科研活动和教学实践中做分享交流。

两个校区均有教学楼实验楼各一座，设有物理、化学、生物实验室、学生图书馆、阅览室及篮球馆、形体教室、计算机教室、录课教室、食堂等设施，教学条件良好。

学校自建校以来，确立了“办学高水平、教学高质量、学生高素质”的办学目标，办学定位：基础性、衔接性。近几年来在教育改革大背景下，重新调整管理结构，强调管理结构服务于学校的办学，学校对“三高”办学目标赋予了新的诠释。“办学高水平”体现一个“变”字，在改革背景下，学校要适应新形势，反应迅速，改革创新求变、求发展，确保在义务教育阶段学校质量的引领地位。“教学高质量”体现一个“实”字，无论是在教学管理、课堂教学还是在课程改革上，都以务实著称，这是学校保持高质量的法宝。“学生高素质”体现一个“全”字，无论道德品质、身心健康以及学业水平都应在尊重个性的基础上得到全面发展，既尊重个性又注重全面。

学校一直把教育教学作为学校的中心工作，并将教学质量作为核心竞争力。学校的教学质量历年来稳居西城区前茅。学校注重培养学生的综合素质和实践能力，为学生未来的发展打下坚实基础，为高一级的学校输送了大批优秀的学生。

学校坚持传授基础知识和发展学生创新能力相结合的教学理念，注重培养学生的综合素质和实践能力。在教育改革背景下，学校优化课程和加强课程体系建设，有效整合与落实国家课程、地方课程和校本课程，构建学校特色课程体系，实现从“教学供给”向“课程供给”的转化。学校注重学生获取知识的宽度和广度，开展了丰富多彩的综合课程和社会实践活动，使学生多读书、多实践、走进自然接触社会，多体验、多探究。

学校在教育改革背景下，落实立德树人根本目标，完善德育工作体系，深入挖掘德育工作内容、拓宽德育工作渠道，整合社会资源，从课程育人、文化育人、活动育人、实践育人、管理育人、协同育人六个方面入手开展德育教育，几年实践下来，德育活动课程化，系列化、常态化，逐步形成我校德育特色，即“三年系列”：三年走遍京城著名博物馆、三年感受大师名人风采、三年人人受益校园文化、三年里课外兴趣活动人人参与，努力为学生搭建提升综合素质的平台，促进学生全面可持续发展。近年来，学生多人次参加国家、市、区级各类竞赛和活动并获得优异成绩。

学校曾获得了“北京市文明单位”、“西城区师德先进校”、“西城区心理教育特色校”、“西城区课改先进校”、“首都文明校园”“西城区先进党组织”等荣誉称号。

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